医院设置孕产保健部、儿童保健部、妇女保健部、计划生育服务部四大部，建设有六个临床中心（河南省新生儿重症救护网络洛阳分中心、洛阳市危重孕产妇救治中心、洛阳市危重新生儿救治中心、洛阳市新生儿质控中心、洛阳市儿童听力筛查诊断中心、洛阳市儿童心理行为中心）；四个研究所（洛阳市生殖医学研究所、洛阳市男科医学研究所、洛阳市围产医学研究所、洛阳市儿科医学研究所）；三个重点实验室（洛阳市生殖与遗传重点实验室、洛阳市儿科学重点实验室、洛阳市出生缺陷预防重点实验室）。医院为国家更年期保健特色专科单位、河南省孕产期保健特色专科单位、河南省新生儿保健特色专科单位、河南省妇幼中医药特色单位，儿童保健科为河南省儿童早期发展标准化建设基地，妇产科、新生儿科、生殖医学科为市级重点专科，康复科为市级特色专科。